Christian Kerez jest zwycięzcą międzynarodowego konkursu architektonicznego na projekt siedziby MSN. Rozstrzygnięcie konkursu miało miejsce 18 lutego 2007 roku – koncepcja przedstawiona przez biuro Christian Kerez Architekt ETH/SIA wybrana została przez międzynarodowe jury spośród 109 zgłoszonych projektów. Wraz z podpisaniem kontraktu rozpoczną się prace projektowe. Termin rozpoczęcia budowy planowany jest na pierwszy kwartał 2011 roku, a jej zakończenie na koniec czwartego kwartału 2013 roku. Muzeum ma być oficjalnie oddane do użytku wiosną 2014 roku.

Budynek Muzeum Sztuki Nowoczesnej będzie pierwszym obiektem zrealizowanym na terenie obecnego placu Defilad. Jego wzniesienie zapoczątkuje proces rewitalizacji ścisłego centrum Warszawy, który ma przebiegać zgodnie z finalizowanym obecnie planem zagospodarowania terenów wokół Pałacu Kultury i Nauki. Zgodnie z wytycznymi tego planu, budynek Muzeum sąsiadować będzie od strony północnej z Parkiem Świętokrzyskim, a od strony południowej z nowym, reprezentacyjnym placem miejskim.

Według warunków kontraktu, całkowita powierzchnia budynku Muzeum wynosić będzie ok. 35 tysięcy metrów kwadratowych, z czego powierzchnia ekspozycyjna zajmie prawie 9 tysięcy metrów kwadratowych – liczby te są porównywalne z powierzchnią całkowitą i powierzchnią ekspozycyjną londyńskiej Tate Modern.

W oczekiwaniu na wzniesienie swej docelowej siedziby, MSN od jesieni 2007 roku prowadzi działalność programową w przekazanym mu przez władze stolicy lokalu przy ulicy Pańskiej. Odbywają się tam spotkania z artystami, wykłady i projekcje filmowe, a otwarcie pierwszej wystawy zaplanowane jest na 24 kwietnia. Od czerwca ubiegłego roku Dyrektorem Muzeum Sztuki Nowoczesnej w Warszawie jest Joanna Mytkowska, która poprzednio pracowała w Centre Pompidou w Paryżu, kuratorka Pawilonu Polskiego na biennale w Wenecji w 2006 roku, współzałożycielka warszawskiej Fundacji Galerii Foksal.