Ministerstwo zdrowia podkreśla, że IMGW dysponuje wysoko wykwalifikowaną kadrą naukową, zapleczem naukowym oraz niezbędnym do przeprowadzenia badań właściwości klimatu sprzętem pomiarowym. Czynniki te kwalifikują Instytut do wykonywania badań oraz do wystawiania certyfikatów potwierdzających dobroczynny wpływ klimatu na zdrowie.
Decyzja podpisana przez ministra Zbigniewa Religę nie upoważnia IMGW do wykonywania badań i wystawiania certyfikatów potwierdzających lecznicze właściwości naturalnych surowców. Chodzi tu m.in. o badania wody uzdrowiskowej. Jak na razie Instytut nie wnosił o takie uprawnienia.
Nadawanie uprawnień do certyfikowania właściwości leczniczych klimatu regulowane są przez rozporządzenie ministra zdrowia z jesieni 2006 roku.